سرویس تحلیل دادههای RNA-seq برای پژوهشگران و مجموعههایی ارائه میشود که قصد دارند از دادههای توالییابی RNA، اطلاعات دقیق و قابل استناد درباره الگوی بیان ژنها به دست آورند. در این خدمت، دادههای خام حاصل از توالییابی پس از بررسی کیفیت، پردازش و همترازی با ژنوم یا ترنسکریپتوم مرجع، مورد تحلیل قرار میگیرند تا میزان بیان ژنها در نمونههای مختلف مشخص شود. این تحلیل در مطالعات مقایسهای، بررسی مسیرهای مولکولی، شناسایی ژنهای دیفرانسیل اکسپرشده، تحلیل پاسخ سلولی به تیمارها، مطالعه بیماریها و کشف بیومارکرهای جدید کاربرد بسیار گستردهای دارد. هدف از این سرویس، تبدیل دادههای پیچیده RNA-seq به نتایجی دقیق، ساختاریافته و قابل تفسیر است تا پژوهشگر بتواند با اطمینان بیشتری از آنها در پروژههای تحقیقاتی، نگارش مقاله و توسعه فرضیات علمی استفاده کند.
برای انجام صحیح و هدفمند تحلیل دادههای RNA-seq، لازم است فایلهای خام توالییابی، معمولا در فرمت FASTQ، به همراه اطلاعات کامل پروژه در اختیار ما قرار گیرد. علاوه بر فایلهای داده، نوع ارگانیسم، تعداد نمونهها، گروهبندی دقیق نمونههای کنترل و تیمار، نوع بافت یا سلول، شرایط آزمایش، پلتفرم توالییابی و هدف اصلی مطالعه باید مشخص شود. اگر پروژه شامل مقایسه بین شرایط زیستی مختلف، شناسایی ژنهای دیفرانسیل، تحلیل مسیرهای زیستی یا بررسی اثر یک دارو یا تیمار خاص باشد، ارائه توضیحات دقیق درباره طراحی آزمایش و متادیتای نمونهها اهمیت زیادی دارد. هرچه اطلاعات اولیه کاملتر و دقیقتر ارائه شود، امکان انجام تحلیل تخصصیتر و استخراج نتایج معنادارتر و متناسبتر با هدف پژوهش فراهم خواهد شد.
در پایان سرویس تحلیل دادههای RNA-seq، مجموعهای از خروجیهای تحلیلی و گزارش نهایی در اختیار کاربر قرار میگیرد که متناسب با هدف پروژه قابل استفاده در مراحل بعدی پژوهش خواهد بود. این خروجیها میتواند شامل گزارش کنترل کیفیت دادهها، نتایج همترازی، ماتریس بیان ژن، فهرست ژنهای بیان شده افتراقی، تحلیلهای آماری، نمودارهای تخصصی مانند heatmap، volcano plot و PCA، و همچنین نتایج تحلیل غنیسازی مسیرها و توابع زیستی باشد. در صورت نیاز، نتایج به صورت جداول و فایلهای استاندارد و قابل استفاده در مقاله، پایاننامه یا گزارش پژوهشی ارائه میشود تا کاربر بتواند با سهولت از آنها در تفسیر دادهها و ارائه نتایج علمی استفاده کند. هدف نهایی این سرویس، ارائه یک تحلیل جامع، شفاف و کاربردی است که دادههای خام RNA-seq را به اطلاعات زیستی قابل فهم و ارزشمند تبدیل کند.
