سرویس اجرای BLAST برای شناسایی توالیهای همولوگ برای پژوهشگران، دانشجویان، آزمایشگاهها و مجموعههای تحقیقاتی ارائه میشود که قصد دارند توالیهای DNA، RNA یا پروتئینی خود را با پایگاههای داده معتبر مقایسه کرده و شباهتهای توالی، هویت مولکولی و روابط احتمالی عملکردی یا تکاملی را بررسی کنند. این خدمت یکی از پرکاربردترین تحلیلهای بیوانفورماتیکی در زیستشناسی مولکولی، ژنتیک، ژنومیکس و پروتئومیکس است و در شناسایی ژنها، تعیین هویت توالیهای ناشناخته، یافتن همولوگها، بررسی conserved domainها و ارزیابی شباهت بین گونهها کاربرد فراوان دارد. در این سرویس، توالی ورودی با استفاده از الگوریتم BLAST و انتخاب نوع مناسب آن مانند BLASTn، BLASTp، BLASTx یا سایر حالتهای مرتبط تحلیل میشود تا نزدیکترین توالیهای مشابه، میزان شباهت، coverage، score و شاخصهای آماری مرتبط بهصورت دقیق مشخص شوند. هدف از ارائه این خدمت، فراهم کردن یک تحلیل استاندارد، دقیق و قابل استناد برای شناسایی توالیهای مشابه و کمک به تفسیر علمی و عملکردی دادههای توالییابی است.
برای انجام دقیق سرویس اجرای BLAST، لازم است توالی موردنظر در فرمت استاندارد مانند FASTA یا بهصورت متنی قابل خواندن در اختیار ما قرار گیرد. همچنین باید مشخص شود که نوع توالی DNA، RNA، cDNA یا پروتئین است و هدف اصلی از جستوجو چیست؛ زیرا بر اساس نوع توالی و هدف پروژه، نوع BLAST و پایگاه داده مناسب انتخاب میشود. در صورتی که کاربر بخواهد توالی خود را در برابر یک ارگانیسم خاص، یک بانک اطلاعاتی مشخص، یک خانواده ژنی خاص یا مجموعهای از توالیهای مرجع بررسی کند، لازم است این اطلاعات نیز اعلام شود. علاوه بر این، اگر هدف پروژه شناسایی ژن، تأیید هویت کلون، بررسی آلودگی، یافتن همولوگهای تکاملی، تشخیص conserved region یا انتخاب توالی برای تحلیلهای بعدی باشد، ارائه این جزئیات به تفسیر دقیقتر نتایج کمک زیادی میکند. هرچه اطلاعات مربوط به توالی، منشأ نمونه و هدف بیولوژیکی پروژه کاملتر باشد، نتیجه نهایی کاربردیتر و متناسبتر با نیاز پژوهشی کاربر خواهد بود.
