استخراج RNA فرآیندی است که در آن مولکولهای RNA از سلولها، بافتها یا نمونههای بیولوژیکی جدا و خالصسازی میشوند. این فرآیند برای مطالعه بیان ژنها، آنالیز ترانسکریپتوم، تشخیص بیماریها و تحقیقات بیومدیکال ضروری است. در این روش، سلولها یا بافتها با استفاده از محلولهای لیز کننده شکسته میشوند تا محتویات سلولی آزاد شوند. سپس، با استفاده از روشهای مختلف مانند ستونهای سیلیکا، استخراج با فنل-کلروفرم یا کیتهای تجاری، RNA از سایر مولکولها مانند DNA و پروتئینها جدا میشود. کیفیت و مقدار RNA استخراجشده با استفاده از روشهای مختلفی مانند الکتروفورز ژل و اسپکتروفتومتری ارزیابی میشود.
برای انجام استخراج RNA، باید نوع نمونه را مشخص کنید، زیرا روشهای استخراج برای نمونههای مختلف (مثلاً خون، بافت، سلولهای کشتشده) متفاوت است. همچنین باید مقدار نمونه را تعیین کنید، زیرا مقدار RNA استخراجشده به حجم یا وزن نمونه بستگی دارد. اگر نمونه از بافت یا سلولهای خاصی است، باید شرایط نگهداری و انتقال نمونه (مثلاً استفاده از یخ خشک یا بافرهای پایدارکننده RNA) را مشخص کنید. علاوه بر این، اگر هدف استخراج RNA با کیفیت بالا برای کاربردهای خاصی مانند توالییابی است، باید این موضوع را اعلام کنید تا از روشها و کیتهای مناسب استفاده شود.
نتایج استخراج RNA به صورت گزارش کامل شامل مقدار RNA استخراجشده (معمولاً بر حسب میکروگرم یا نانوگرم) و ارزیابی کیفیت آن ارائه میشود. کیفیت RNA با استفاده از نسبت جذب نوری در طول موجهای ۲۶۰/۲۸۰ و ۲۶۰/۲۳۰ نانومتر و همچنین الکتروفورز ژل ارزیابی میشود. گزارش حاوی اطلاعاتی درباره یکپارچگی RNA (مثلا وجود باندهای ۲۸S و 18S rRNA در ژل) و خلوص آن خواهد بود. در صورت درخواست، RNA استخراجشده در لولههای استریل و با حجم و غلظت مشخص تحویل داده میشود. علاوه بر این، اگر نمونه برای کاربردهای خاصی مانند سنتز cDNA یا توالییابی آماده شود، نتایج مربوط به آمادهسازی نیز در گزارش گنجانده میشوند.
